През 2009 г. секциите по „Агротехника, физиология и икономика” и „Растителна защита” са обединени в един отдел -

“АГРОТЕХНИКА, РАСТИТЕЛНА ЗАЩИТА И ИКОНОМИКА НА КУЛТУРНИТЕ РАСТЕНИЯ”.

В състава на отдела са включени 12 специалисти - двама доценти, трима главни асистенти, един асистент (шестима доктори), двама старши експерти, трима старши специалисти агротехници и един старши специалист лаборант.

Научноизследователската дейност в отдела е насочена към:

• Установяване на биологически и стопански изгодни формировки при ябълка и череша и прилагане на подходяща резитба за формиране на короните и поддържането им през плододаващия период;
• Оптимизиране на хранителния режим при ябълка, череша и слива чрез подходящо органо-минерално торене;
• Изясняване ролята на агротехниката върху развитието на неприятелите по овощните видове;
• Идентифициране на причинителите на вирусни болести по семковите и костилковите овощни видове. Проучване на разпространението им и характеристика на икономически най-важните вирусни болести;
• Установяване видовия състав и популационната динамика на основните вредители по черешата, вишнята, ябълката, сливата и на техните биологични регулатори – хищници и паразити; ролята на екологичните фактори върху плътността на неприятелите и размера на щетите, които причиняват и разработване на борбата срещу тях;
• Разработване и внедряване на технологии за конвенционално, интегрирано и биологично производство на ябълки, череши и сливи;
• Икономическа оценка на технологии за създаване и отглеждане на ябълкови, черешови и сливови насаждения;
• Установяване на подходящи технологии за отглеждане на зелеви култури (броколи, карфиол, главесто зеле), домати, нетрадиционни култури (манголд, салатно цвекло), междуредови култури (грах, нахут, фасул).
• Въздействие на екологизацията на Общата селскостопанска политика върху биоразнообразието и околната среда в земеделските стопанства и селските региони; икономическа ефективност от прилагане на екологични практики в овощарството; иновативни маркетингови решения в земеделските стопанства; развитие и диверсификация на селските райони.